Το μέσο βάθος της Βαλτικής Θάλασσας είναι 55 μέτρα. Η παλίρροια είναι πολύ αδύναμη (περίπου 30 εκατοστά) και μερικές φορές καλύπτεται από τις κλιματικές ταλαντώσεις (υδροδυναμικά μοσχεύματα, κύματα καταιγίδων). Η Βαλτική είναι μια ρηχή θάλασσα (10 ανά χίλια έναντι 35 ανά χίλια στους υπόλοιπους ωκεανούς). Στην πραγματικότητα, η εισροή γλυκού νερού από ποτάμια είναι πολύ σημαντική κατά τη στιγμή της τήξης και η φυσική εξάτμιση είναι μόνο ίση ή ελαφρώς μεγαλύτερη από την άμεση βροχόπτωση. Η ετήσια διακύμανση της αλατότητας αντιπροσωπεύει το αρνητικό των ποτάμιων καθεστώτων. Με άλλα λόγια, κατά τη διάρκεια της χαμηλής ροής των ποταμών, τον Φεβρουάριο, η αλατότητα της θάλασσας είναι μέγιστη. ενώ είναι ελάχιστο όταν οι ποταμοί έχουν ισχυρή ροή, τον Μάιο, με την τήξη των χιονιού. Γενικά, τα ανατολικά και τα επιφανειακά ύδατα είναι πιο αραιά αλατισμένα (Δανικά Στενά: 10 ‰, κόλπος της Βοθνίας: 5 ‰).
